塞尔达传说:灵魂轨迹的游戏创新
火车系统:《轨迹》和历代塞尔达传说最不一样的设定大概就是火车的存在了。与他之前的作品《风之杖》和《沙漏》不同，林克没有在海洋上航行，在岛上冒险，而是变成了铁轨上的火车，在停靠点冒险。轨迹是系列中第一次出现车辆“火车”。在游戏中，玩家可以操纵林克在遍布铁轨的平原上航行。《轨迹》的火车行程受到路线上铁路轨道的限制，如果撞上敌方火车，会立刻打过去，比前作自由度小。
在与列车相关的辅助任务方面，轨道列车增加了接送乘客和运输货物的辅助任务。在游戏中，有些NPC会要求搭载Link的列车或者运送货物到其他车站，满足他们的要求，就可以解锁全新的轨道。这个设定完成度挺高的，任务量也挺大的。其中有些是可以重复播放的——但这也导致了游戏“轨迹”的大部分全过程都是在列车启动中完成的，这是不可避免的。
说到火车，就会提到本的名字。《大地之哨》的日文翻译和《灵魂轨迹》的英文翻译虽然不同，但都击中了游戏的中心思想，那就是在大陆上开火车的冒险。有的解释简单地把“哨子”这个词解释为火车哨子，强调这个哨子在游戏中的各种用途，这是完全错误的；这里的汽笛指的是火车。
火车零件系统:这个系统可以说是继承了沙漏的船零件系统。在这款游戏中，林克将在他的冒险中获得一些宝物，这些宝物可以用来换取新的火车部件，包括车头、乘客车厢、货物车厢和大炮。一整列火车只需要四个零件，比之前游戏“一艘船需要八个船零件”简单多了。这种用宝物换零件的方式，也比之前“打开宝箱随机获取”的方式更人性化，让火车零件的收集更有目的性。而火车零件除了改变火车外观，增加火车的耐用性外，没有多余的用途。这也是之前作品的问题，Trajectory一直没有改进。
乐器演奏:《轨迹》的乐器演奏是迄今为止整个系列中最接近真实乐器演奏的。在游戏中，林克可以演奏一种叫做“灵笛”的乐器，通过演奏特定的曲目来解谜。这种设计在《塞尔达传说》系列中很常见，但《轨迹》将它带到了一个新的高度:演奏乐器时，我们需要在触摸屏上“触摸”笛子来控制乐器的位置，并且必须向ds的麦克风吹气，笛子才会发出声音——相当于整个手持设备变成了一个可以演奏的乐器。此外，《轨迹》首次在游戏中加入了“合奏”系统。在剧情中，林克需要和公主、贤者一起演奏一些感人的音乐，无论是乐感还是节奏感都是对玩家的考验。每一次表演都有很强的代入感，每一次合奏都有很出色的编曲，相比之前的作品《沙漏》有很大的进步。
双重谜题:说到轨迹，就不得不说说《轨迹》中林克和塞尔达公主的互动。这部作品中的迷宫“灵魂之塔”继承了《沙漏》和《海王神庙》中“幻影骑士”的敌人，但在这部作品中，林克可以通过攻击幻影骑士让塞尔达的灵魂融入其中，从而同时操控林克和幻影骑士。沙漏中首次出现了这种两个人的触屏操作，轨迹将其推广到了游戏主线中的解谜部分，设计了一些精彩的双人拼图。游戏中，不同的幻影骑士效果不同，有的可以点亮平台，有的可以瞬移，有的可以滚动。有些谜题只有特殊的幻影骑士才能解开。林克可以骑在幻影骑士身上，和幻影骑士一起推门，甚至可以用鞭子抽打幻影骑士...很多乐趣都在等待玩家去发现自己，值得一试。
隐藏站挑战:说到轨迹的侧面任务，除了火车载客载货，还得说说‘隐藏站’。在轨迹地图上有一些隐藏的站，可以通过解锁新的轨迹到达。这些站一般都有珍贵的收藏宝藏，但都需要链接解决一些谜题才能到达。这种迷宫般的边拼图有时甚至比主拼图还要耗时，在某种程度上非常具有挑战性。
Boss Rush挑战:一款在《轨迹》中相当出彩的小游戏，Boss Rush(boss Sweep)游戏。游戏分三关，让林克挑战一群群敌人，有点类似于《风之杖》和《黄昏公主》系列中的“试炼洞”。但不仅如此，这款游戏还允许林克反复挑战迷宫中出现的boss，为游戏增加了重复玩法的可能性——在第三关结束时，还可以挑战隐藏的boss，经典的暗影林克。这种对boss设定的反复挑战，在之前的游戏中是没有的。这个设定在后来的《时笛3d》和《天空之剑》系列中得到了继承。