EVA的问题
第一次冲击
第一次冲击是指发生于大约40亿年之前一次陨石撞击。依据月球碰撞形成学说，这次撞击是地球的卫星——月球，形成的原因。第一次冲击在原作中没有被直接提及，但在TV版第七集画面中的一份文档上可以看到相关的描述。根据经过PS2游戏EVA2确认的说法，这枚陨石事实上就是包裹着莉莉斯的黑之月。撞击发生后，它的大部分反弹脱离地球，形成月球，而包含莉莉斯的一小部分留在了地球上。
第二次冲击
第二次冲击是指2000年9月13日，在南极进行的针对亚当的接触实验所引起的一系列灾难。被唤醒并且受伤了的亚当释放出强大的反AT力场引发大爆炸。爆炸导致整个南极冰帽的融化并改变了地球的倾角。严重的洪水和海啸紧随而来，南半球的20亿居民当场遇难。爆炸发生后两天，为了争夺紧缺的食物和资源，印度和巴基斯坦之间展开了战争。争端很快弥漫到了全球，世界大战开始了。直到2001年2月14日，情人节条约（TheValentineTreaty）签订后，战争才逐渐平息。这些事件导致地球人口骤减至原来的一半。
第二次冲击导致的全球海平面上升和气候变化，引发了严重的环境危机。许多旧有的沿海城市被淹没。此外，日本成为了常年处于夏天的国家。本作中一个微妙的暗示在于，在野外场景中，我们始终能听到蝉的鸣叫声。而这种动物在日本通常只在夏季出没。
在官方的说法中，回避了涉及极机密的亚当和接触实验。为了掩盖事实，第二次冲击被描述为由一系列过小（大约10厘米）和过快（95%光速）而无法被检测到的陨石撞击引发的爆炸。考虑到远古时代的那次导致月球形成的陨石撞击称为第一次冲击。官方便将此难称作第二次冲击。在NERV内部，只有少数几位成员知道引发第二次冲击的真正原因。
在《新剧场版：序》中没有提到第二次冲击的发生日，但片中一开始的日本外海已经是死海一片，推测应该是与第二次冲击有关。
第三次冲击
第三次冲击是死海文书上预言的最终事件，也是SEELE试图实现的最高目标。
这一冲击是由亚当和莉莉斯的结合所触发，并最终创造一个继承地球上所有人类的神的存在。NERV和SEELE的目标，是确保由人类而不是使徒来触发第三次冲击。即“人类补完计划”。为实现这一计划，人类必须击败守护“生命之树”的使徒。
（四）地点
黑之月
黑之月是莉莉斯之卵，是人类灵魂的诞生地。被埋于地下，无意间被NERV作为基地。
白之月
白之月是所有使徒诞生的卵，位于南极。（根据新剧场版描述,使徒来自月球,所以可能暗指白之月为月球）
地底都市（NERV总部）
一个球状的洞穴，由二十二层武装隔板保护，位于第三新东京市底下。NERV的总部就是位于地底都市之内。直径约6公里，但约有81%被土埋没。若是说第三新东京市是个要塞都市的话，那么这里就是要塞的内部了。相对于地面上多半用于军事用途的建筑物，这里则是一般市民的主要收容所。建有轨道列车为出入之工具。利用上方第三新东京市之集光大楼透过光纤将光线传送到这里。电力需由外界提供。为了防范使徒的直接攻击，它和地面之间有22层的特殊装甲板。不过，再强的保护措施，似乎还是挡不住使徒接二连三的入侵……
剧集后来透露这儿原来是莉莉斯之卵的所在地，是人类灵魂诞生的地方。
NERV第二支部
NERV第二支部（NERV-02）是NERV北美支部，位于内华达沙漠内某处。EVA四号机在NERV-02启动实验时将之连同方圆89公里范围内的一切物体摧毁。
NERV第三支部
NERV第三支部（NERV-03）简称“德国NERV”，是NERV德国支部。EVA二号机建造于此。在联合国海军护卫下被运送到位于第三新东京市的NERV总部前，明日香显然和二号机在此接受过一段时间的训练。
第三新东京市
第三新东京市（Tokyo-3）位于地底都市上方。市内建筑可以于必要时缩入地下以保障安全，有些内藏EVA的巨型装备。第三新东京市被建造作为首都以取代第二新东京市，实际上被设计用来阻截所有前来日本的使徒。城市被众多环绕其的防卫导弹发射台所保护，坐落于第二次冲击前的日本箱根（日本本州岛东南部城市）。
第二新东京市
第二新东京市（Tokyo-2）是日本首都，于第二次冲击导致第一东京市毁灭后建立。位置在今日本长野（日本本州岛中部城市）。
东京
故事中曾展现部份水底下被毁的东京。在第二冲击引起的战争中，东京被投下第一枚N?炸弹而遭破坏。故事中亦提及过一份有关第二次冲击的官方文件（见)。在EndofEvangelion中，日本首相希望第三新东京市完全破坏到不适合任何生物居住的程度，然后“二十年内禁止任何人接触……好像旧东京一样”
终极教条（TerminalDogma）（タミナルドグマ）
位于NERV总部的最底层，也是莉莉斯与隆基努斯之枪的所在地。表面上，终极教条长期封锁，但是NERV的高层（如碇源堂、冬月耕造、也可能包括律子）却可以入内；另外，加持良治在完成他的最后任务之前，也曾进入终极教条，向美里展示内里的情况。
有时候终极教条区和中央教条区的设定会混为一谈，在新剧场版中被设定为L-EEE层的一部分，另外在新剧场版中，是美里带着真嗣进去L-EEE层去看莉莉丝。
中央大垂直沟
位于NERV总部底深遂广阔的地下空间。它的最底层存在着LCL之海，以及钉在红十字架上的LILITH。
中央教条（CentralDogma）（セントラルドグマ）
NERV总部内金字塔状的控制中心，位于终极教条的正上方。中央教条的名称源自分子生物学中的中心法则，指“DNA-RNA-Protein（蛋白质）”转换时的不可逆讯息流。该条款解释了编译人类基因图谱的概念。
南极洲
第二次冲击发生的地方。因为第二次冲击，南极洲受到彻底破坏，现在已经变成毫无生机的一片红色海洋，海面上只剩下尖锐突出的冰柱。如缺乏保护，人类不能在那里生存。
LCL之海
LCL之海是一个没有AT力场的世界。在这个世界，人类的意识无分彼此，所有人的灵魂都栖息于由莉莉斯的血构成的巨大海洋之内。这是SEELE认为人类存在的终极理想形态，亦是该组织执行的人类补完计划的最终目标。
Confort17mansion
美里等人所住的公寓，但整栋就只有美里他们住而已，其他均是空房，原因不明…附带一提，美里住在第11楼。
第一脑神经科
真嗣等适任者需要住院时一定住到这里来。
人工进化研究所
SEELE的调查组织Gehirn（NERV的前身）为了掩护之用而设的机构，而其3号分室是零出生养育的地方，这里的光和水让零留有深刻的印象。研所的所长是源堂，设立于公元2003年。
第三新东京市立第一中学
真嗣等人的学校，适任者及候补人选均编在2年A班。
（五）其他
死海文书
又名死海古卷或死海卷轴，1947到1956年间在Qumran地区发现的古代希伯来文手稿，记载了未被收入圣经的福音书。在动画中，它们在SEELE手中，记录了关于未来发生事件和使徒到来的预言。新剧场版中似乎另有死海文书外典的存在
NERVLogo
半片无花果树叶(在创世记中,亚当和夏娃吃了智慧树的果实后以自己一丝不挂为耻,于是用无花果树叶盖着自己的生殖器)和NERV字母的组合，半边围绕着God'sinhisheaven,All'srightwiththeworld.的字样。
人类补完计划
由SEELE、人类补完委员会与碇元渡***同推进的极密计划，目的是决定未来人类进化与发展的方向，具体内容不明。SEELE与人类补完委员会依照“死海古卷”与“里死海古卷”中的记录来推进计划的步伐，他们的目标，是“为了封闭的人类再生的通过仪式”。但执行仪式用的“隆基亚斯之枪”被意见分歧的碇元渡以与使徒作战不得已的借口，由零号机抛到了月球轨道，但是在剧场版《AIR/真心为你》在SEELE要用EVA来引发第三次冲击(即“人类补完计划”)开始后。而隆基亚斯之枪也从月球飞回被九个量产型五号机拖着的初号机前面(而且真嗣正在驾驶)，而九个量产型五号机和初号机便与隆基亚斯之枪组成生命之树。
E计划
E计划是建造一系列EVA的计划，亦促成了NERV的成立。E计划又被称为亚当复活计划。
卡尔巴拉生命之树
当人类补完计划开始时，初号机成为一株类似树的东西，其根向天空散布，其枝蔓延地面。根据冬月的描述，“初号机回归成生命之树…”。其枝与根相颠倒的生命之树，在印度教与犹太秘教经典中亦有描述，称为“倒吊之树”。
CODE601
三贤人超级计算机系统的电脑代码；表示资料不明、无法分析。
666防壁
剧中MAGI除了防火墙以外，另一种用来对抗外部的黑客入侵的方式，一般认为这是源自UNIX的权限保护观念而产生的术语。
A-17
一个由NERV所发布的紧急命令，为了方便NERV捕捉第八号使徒而可以便宜行事。包含封锁箱根的陆空交通、对外管制消息等。
A-801
此命令由日本政府发布。它废止了对NERV的法律保护，并将联合国授权转移给日本政府，以便日本政府武力占领NERV总部。
A10神经
在神经学中，它是在人脑中产生吗啡成分，同时产生快感的部位。同时它还管理人脑的记忆。在动画中，A10神经的脉冲及同步率与EVA机器人同驾驶
头部接口装置
此装置是EVA驾驶员用来连接A10神经与机器人的。此装置同时也让驾驶员感受到机器人所受到的各种感觉。
圣痕
真嗣在第三次冲击发生时手掌上被打下了烙印。他的双手上出现的钉伤，随后他进入梦境状态。
瓦伦丁条约
在2001年2月14日世界各国签订的一个条约，以结束持续的战争。由于其签订的时间，那场战争也被称为“情人节战争”。
暴走
当初号机的驾驶员碇真嗣的情绪到达了极端，就会产生失去自我控制的反应，也因为如此使得他和初号机的同步率可以大幅度的提升，甚至最大化，这段时间内初号机是以“自己的行为思考模式”而行动，初号机特性转为凶残无比。而“暴走”一词更是成为后来解释“失去控制”的新代名词。
适任者
不知为何，EVA的驾驶员必须是年龄为14岁并已失去母亲的少男少女。由“人类补完委员会”与NERV对符合上述条件的少年进行审查后，获批准者便可以驾驶EVA，其使命是与使徒进行战斗。在作品中，成为所谓的“适任者”究竟是那些少男少女的幸运还是不幸呢？恐怕很难作出明确的答复……
（七）非主线剧情术语
D-typeEquipment（D型装备）
供EVA机体所穿着的潜水服装备，耐高热高压。第十集中，贰号机为了捕捉呈胚胎状的使徒而进行熔岩潜泳时，就是着D型装备。D为Diving(潜水)的字首。
F-typeEquipment（F型装备）
由NERV制造的纯战斗用重型装备,首要目的为加强初号机的战斗能力和速度,中子小刀是参考2号机而成,双膝装备了尖刺,功用于暴走时更显而易见。虽然如此,但身体都装备了限制装甲,防止初号机暴走。(但始终都防止不能......)F的意思是Fight
MagorokuExterminateSword（マゴロク?エクスターミネート?ソード）
初号机使用的一件武器，是一把又剑又枪的武器。只出现于超级机器人大战，在原作中并无出现过。